Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms