Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms