Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igdcc4Q9EQS9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igdcc4Q9EQS9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms