Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms