Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tspan4Q9DCK3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan4Q9DCK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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