Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms