Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop7Q9DCH2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms