Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms