Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmg20aQ9DC33 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms