Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms