Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmco5aQ9D9D5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmco5aQ9D9D5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms