Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms