Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Derl3Q9D8K3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms