Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan13Q9D8C2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan13Q9D8C2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms