Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms