Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms