Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbe1Q9D6Y9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms