Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb4aQ9D6F9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms