Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip1Q9D620 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip1Q9D620 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms