Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins2Q9D600 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins2Q9D600 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms