Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms