Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms