Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms