Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms