Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp4Q9D4F8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms