Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp2bpQ9D4C6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms