Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag1Q9D3E6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms