Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms