Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Krt20Q9D312 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Krt20Q9D312 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Krt20Q9D312 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Krt20Q9D312 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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