Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms