Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1U0

Grifin, Grifin, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrifinQ9D1U0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GrifinQ9D1U0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GrifinQ9D1U0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms