Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms