Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms