Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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