Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms