Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfc5Q9D0F6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rfc5Q9D0F6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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