Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms