Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms