Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrs1Q9CYH6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms