Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms