Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpl11Q9CXW4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms