Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms