Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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