Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms