Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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