Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms