Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PompQ9CQT5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PompQ9CQT5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PompQ9CQT5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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