Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms