Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms