Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znhit3Q9CQK1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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